MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus johnsonii DPC 6026 chromosome

Total Repeats: 6491

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017477	TAA	2	6	1370	1375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017477	TTA	2	6	1406	1411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017477	GT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017477	CTA	3	9	1472	1480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017477	AT	3	6	1496	1501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017477	TAAA	2	8	1505	1512	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017477	AGG	2	6	1534	1539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017477	T	7	7	2705	2711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017477	A	6	6	2803	2808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017477	A	7	7	2842	2848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017477	A	6	6	2894	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017477	AT	3	6	2917	2922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017477	AGA	2	6	2944	2949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017477	A	6	6	8705	8710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017477	T	6	6	8719	8724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017477	TAA	3	9	8728	8736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017477	A	6	6	8764	8769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017477	T	6	6	8780	8785	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017477	ATT	2	6	8819	8824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017477	AGG	2	6	8870	8875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017477	ATT	2	6	8880	8885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017477	TAA	2	6	10010	10015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017477	T	6	6	10048	10053	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017477	TAT	2	6	10058	10063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017477	AAG	2	6	10066	10071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017477	TGCT	2	8	11007	11014	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017477	GAT	2	6	11022	11027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017477	AAGC	2	8	11028	11035	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017477	T	6	6	11037	11042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017477	TATAA	2	10	11047	11056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017477	ATG	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017477	TAT	2	6	11069	11074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017477	TGA	2	6	11078	11083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017477	AGGA	2	8	11100	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017477	ATTA	2	8	14997	15004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017477	CTATA	2	10	15006	15015	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017477	AT	3	6	15959	15964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017477	T	6	6	15995	16000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017477	TAT	2	6	17190	17195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017477	TTTTA	2	10	17196	17205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017477	AGA	2	6	17232	17237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017477	A	6	6	17249	17254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017477	CTT	2	6	17269	17274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017477	TTA	2	6	19354	19359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017477	ATT	2	6	19385	19390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017477	AAAAT	2	10	19413	19422	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017477	TAACT	2	10	19428	19437	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017477	A	6	6	19438	19443	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017477	A	7	7	19446	19452	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017477	TAA	2	6	19464	19469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017477	AT	3	6	19471	19476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017477	ATG	2	6	19543	19548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017477	A	6	6	19589	19594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017477	T	7	7	19616	19622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017477	A	6	6	21006	21011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017477	T	6	6	21065	21070	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017477	CA	3	6	21084	21089	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017477	GAG	2	6	21122	21127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017477	GAA	2	6	21128	21133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017477	ATT	2	6	21207	21212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017477	AAT	2	6	21221	21226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017477	AT	3	6	21229	21234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017477	TAAT	2	8	21246	21253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017477	A	6	6	21262	21267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017477	ATC	2	6	21285	21290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017477	ATG	2	6	21356	21361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017477	T	6	6	21424	21429	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017477	TAT	2	6	21469	21474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017477	A	7	7	21493	21499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017477	AGAT	2	8	22689	22696	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017477	TTA	2	6	22703	22708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017477	TATTT	2	10	23621	23630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017477	T	6	6	23637	23642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017477	TTCA	2	8	23668	23675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017477	GCTAA	2	10	23677	23686	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017477	GTG	2	6	23707	23712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017477	A	7	7	23736	23742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017477	CAC	2	6	24658	24663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_017477	T	6	6	25407	25412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017477	TAATA	2	10	25423	25432	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017477	AT	3	6	25460	25465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017477	GTT	2	6	25475	25480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017477	AGAAA	2	10	25490	25499	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017477	TAT	2	6	25507	25512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017477	CCA	2	6	25519	25524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017477	TC	3	6	25539	25544	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017477	ATC	3	9	25554	25562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017477	TGG	2	6	25563	25568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017477	CAAACC	2	12	25572	25583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017477	ATC	2	6	25589	25594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017477	ATT	2	6	25658	25663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017477	T	6	6	27335	27340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017477	CTT	2	6	27351	27356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017477	AGC	3	9	27360	27368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017477	CTT	2	6	27374	27379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017477	AT	3	6	28286	28291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017477	GTG	2	6	28378	28383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017477	TAT	2	6	29260	29265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017477	T	6	6	29300	29305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017477	CAC	2	6	29329	29334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017477	ATT	2	6	29353	29358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017477	GAA	2	6	29365	29370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017477	ACA	2	6	29378	29383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017477	TA	3	6	29401	29406	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017477	TAA	2	6	29411	29416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017477	TAA	2	6	29472	29477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017477	AAC	2	6	29549	29554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017477	TAC	2	6	29577	29582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017477	AAATC	2	10	29640	29649	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017477	CTT	2	6	30706	30711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017477	AGT	2	6	30722	30727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017477	TAA	2	6	30733	30738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017477	A	6	6	30781	30786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017477	TAAA	2	8	31566	31573	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017477	TTTG	2	8	31590	31597	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017477	TATT	2	8	31659	31666	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017477	CTT	2	6	31758	31763	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017477	TAT	2	6	31802	31807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017477	AC	3	6	31835	31840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017477	CTT	2	6	31874	31879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017477	CACGAA	2	12	31934	31945	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017477	T	7	7	31968	31974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017477	TCAC	2	8	32030	32037	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017477	TTCT	2	8	32038	32045	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_017477	TCT	2	6	32049	32054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017477	ATC	2	6	32067	32072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017477	AT	3	6	32133	32138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017477	T	7	7	32214	32220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017477	A	6	6	32225	32230	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017477	CAAT	2	8	32258	32265	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017477	CAC	2	6	32267	32272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017477	AAG	2	6	32284	32289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017477	GTG	2	6	32354	32359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017477	TAA	2	6	32379	32384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017477	A	6	6	32383	32388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017477	GTA	2	6	32413	32418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017477	TCTGA	2	10	32434	32443	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017477	CAC	2	6	33302	33307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017477	TAA	2	6	33311	33316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017477	AGG	2	6	33325	33330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017477	GA	3	6	34521	34526	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017477	AGTA	2	8	34582	34589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017477	TCCAG	2	10	34598	34607	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017477	AGCCC	2	10	34670	34679	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
145	NC_017477	AAT	2	6	34748	34753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017477	AT	3	6	34752	34757	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017477	TAT	2	6	34772	34777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017477	TAAAAT	2	12	34798	34809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017477	GAA	2	6	34849	34854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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